福建医科大学附属第二医院鲤城院区拥有多个科室，包括但不限于：内科、外科、儿科、妇产科、眼科、口腔科、耳鼻喉科、皮肤科、骨科、神经科、肿瘤科、心脏内科、心血管外科、泌尿外科、消化内科、消化外科、呼吸内科、康复医学科、传染病科、中医科等。 这些科室为患者提供了全方位的诊疗服务，覆盖了各种常见病、多发病和疑难病症的治疗领域。 除此之外，医院还设有检验科、放射科、药剂科、麻醉科、心理咨询科等配套科室，为患者提供全面的医疗服务和关心。 无论是门诊还是住院患者，福建医科大学附属第二医院鲤城院区均能提供专业的医疗服务，满足患者的不同需求。