安徽农业大学农学院拥有丰富的专业设置，包括农学、植物保护、园艺、种子科学与工程、设施农业科学与工程、草业科学、林学、水土保持与荒漠化防治、土壤学、植物营养学、动物科学、动物医学、草业科技、森林保护、经济学、农业经济管理、国际经济与贸易、农村区域发展、食品科学与工程、食品质量与安全、农业工程、农机化及其自动化、农业电气化与自动化等专业。 这些专业广泛涉及农业科技、农业管理、农村发展等领域，为学生提供了全面系统的农业知识和技能培养，帮助他们成为农业领域的专业人才。