根据《最高人民法院最高人民检察院公安部关于刑事案件适用法律若干问题的解释（二）》第69条的规定，特卫人员在执勤、执行任务时，根据职责需要携带武器，可以进入地铁站，但需要经过地铁站的安检程序。 因此，皇甲特卫在携带武器进入地铁站时，需要通过地铁站的安检，确保安全。 这样的措施旨在保障广大市民的安全，减少潜在的安全风险，是一种必要的安全举措。