首先，《三遂平妖传》是由袁崇焕创作的，主要讲述了明代抗倭英雄袁崇焕为平定妖魔而进行的故事。
小说以历史背景为基础，描绘了袁崇焕奋勇搏杀、巧妙斗妖的英雄形象，强调了正义战胜邪恶的主题。
故事情节紧凑，充满了悬疑和刺激的元素。
而《平妖传》则是明代文学家冯梦龙所作，情节较为细腻且优美。
该小说主要讲述了宁静村庄遭遇妖魔困扰，一位具有天赋异禀的年轻人出现并带领村民们与妖魔作战的故事。
小说中注重表现人性情感和对人性的探索，充满了浓郁的民间色彩和人情味道。
总体而言，两部小说的主题相似，都是围绕平定妖魔而展开的故事。
然而，《三遂平妖传》注重英雄形象和历史背景，充满了刺激与悬疑；而《平妖传》则更加注重描写人性情感，呈现出了浓郁的民间风情。
这些差异使得两部小说在情节、风格和主题上有所不同。