科学院院士与工程院院士之间在待遇上存在一定差异。
科学院院士是指被中国科学院聘为院士的专家学者，主要从事基础科学研究，享有科学研究的自由，拥有充分的学术权威地位。
而工程院院士则是指被中国工程院聘为院士的专家学者，主要从事工程技术研究与应用，对国家的工程建设和技术发展起到重要指导作用。
在待遇上，科学院院士相对工程院院士来说，更多地侧重于学术研究方面的荣誉与支持。
科学院院士在学术研究方面享有较高的荣誉地位，并且可以参与科研项目的申请和指导，并享受相应的研究经费。
而工程院院士在工程技术方面享受更多的实践和应用的机会。
工程院院士可以参与国家重大工程项目的决策与指导，影响我国的工程技术发展方向，并享受相应的工程项目经费和技术支持。
总体来说，科学院院士与工程院院士在待遇上存在一定区别，且分别适用于不同的学术领域和研究方向。
科学院院士侧重于基础科学研究，享有较高的学术荣誉和研究支持；工程院院士则聚焦于工程技术研究与应用，参与国家重大工程项目并享有相应的项目经费和技术支持。