是的，合肥旅游汽车站和客运总站是有区别的。
合肥旅游汽车站是专门用于接待旅游客运的汽车站，主要提供出发和返回合肥市各个景点的旅游大巴车辆。
而客运总站则是一个综合性的汽车站，提供城市内外的普通客运、包车、大巴等服务。
合肥旅游汽车站与客运总站在服务对象、服务内容和经营范围上都存在差异。
合肥旅游汽车站的主要职责是为游客提供与旅游相关的车辆和服务，以满足游客在合肥市内外旅游的需求。
该汽车站通常位于市区或景点附近，设有专门的旅游咨询台，提供详细的旅游资讯和导游服务。
而客运总站则是城市内外交通枢纽，不仅提供长途客运服务，还负责城市公交、包车等服务，面向公众提供更为广泛的交通服务。
客运总站通常坐落在交通便利的位置，拥有更多的车辆和线路选择，满足不同人群的出行需求。
综上所述，合肥旅游汽车站和客运总站在服务对象和服务内容上存在差异，旅游汽车站主要服务于旅游客运，而客运总站则更为普遍地服务于城市内外的客运需求。