治疗细菌感染扁桃体化脓的最好药物应该是抗生素。
常见的抗生素如青霉素、阿莫西林等可以有效杀死细菌，减轻炎症和疼痛症状。
此外，当感染较为严重时，可能需要口服或静脉注射更强效的抗生素。
还需要注意的是，在使用抗生素的同时，要注意口腔卫生，多饮水，适当休息，加强免疫力。
如果病情持续恶化或者抗生素无效，建议及时就医寻求医生的进一步指导和治疗措施。
细菌感染扁桃体化脓是一种常见的疾病，如果不及时治疗，会导致严重的疼痛和并发症的发生。
因此，对于化脓性扁桃体炎，抗生素是首选治疗药物。
但是需要注意的是，抗生素只能杀死细菌，对病毒和真菌无效，因此在确定感染是由细菌引起的情况下才应使用抗生素。
同时，在使用抗生素的过程中，要遵医嘱进行正规用药，避免滥用或过量使用抗生素，以免产生耐药性。
此外，患者还应保持良好的口腔卫生，避免辛辣食物刺激，适当休息，并补充足够的水分，以加强免疫力，促进康复。
遵循医生的建议，并及时复查跟进，能够更好地进行治疗和康复。