它们在结构和作用机制上有所不同。
兽用磺胺嘧啶钠是一种磺胺类抗生素，主要用于治疗动物的细菌感染。
它通过抑制细菌的二氢叶酸合成来发挥抗菌作用。
磺胺嘧啶钠广谱抗菌活性强，对革兰氏阳性和阴性菌有一定的杀菌作用。
在兽用药物中被广泛使用。
而磺胺间甲氧嘧啶钠是一种合成抗菌药物，也是属于磺胺类抗生素。
它是甲氧基的衍生物，它的作用机制与兽用磺胺嘧啶钠类似，都是通过抑制细菌的二氢叶酸合成酶来杀灭细菌。
磺胺间甲氧嘧啶钠在临床上主要用于治疗复杂性尿路感染与急性支气管炎，对于某些多重耐药菌株的感染也显示出一定的疗效。
总结起来，兽用磺胺嘧啶钠和磺胺间甲氧嘧啶钠都属于磺胺类抗生素，它们通过抑制细菌的二氢叶酸合成来抗菌，只是在药物的具体结构上有所不同，因此在临床应用上有一些差异。