侯耀文遗产案最后的结局是他的长女和独生子女相互打官司，争夺遗产的分配。 因为侯耀文在遗嘱中并没有明确指定他的财产如何分配，导致他的遗产成为争议焦点。 法庭最终判决，将侯耀文的遗产以公平的方式平分给他的长女和独生子女。