万历国本之争为什么不杀大臣是因为皇帝万历期间的国本之争是一场政治斗争，并非涉及大臣的人身安全问题。 在此期间，万历皇帝通过国本之争来掌握国家权力并打破儒家士大夫的垄断地位。 他主要通过改变官员选拔制度、制订新的考试制度，以及批评现行政策等手段来推动改革。 因此，他更倾向于用政治手段来解决争议，而不是诛杀大臣。 此外，万历皇帝也深知诛杀大臣可能引发政治动荡和社会不稳定，因此他选择了相对稳定的政治解决方式。