国债逆回购手续费一般是在结算时扣除。 当投资者进行国债逆回购交易时，手续费会根据交易金额和相关规定的费率进行计算。 而结算时，手续费会直接从投资者的回购款项中扣除。 手续费的扣除是根据交易所或券商的政策而定的，一般会在结算前自动完成。 因此，在国债逆回购中，投资者需要考虑手续费对回购利益的影响，并在交易前对此费用有所了解和准备。