黑龙江农业工程职业学院是一所专科院校，属于中国的高等职业教育机构。 根据中国教育部的规定，本科院校是指拥有本科学位授予权的高等教育机构。 而农业工程职业学院属于职业学院的范畴，主要培养技能型人才，学制为3年。 因此，从学历层次上来说，黑龙江农业工程职业学院并不是本科院校。