安置汉长安城遗址剩下的村庄可以考虑以下方案：首先，对于需要保护的文物和历史建筑，应进行修复和保护工作，以确保其保存完好。 其次，可以根据村庄的规模和需求，进行规划和重新建设，提供现代化的基础设施、居住条件和就业机会。 此外，还可以推动农村旅游的发展，吸引游客前来参观和体验，为村庄提供经济支持。 当地政府可以提供相应的政策和资金支持，协助村民安置和产业发展，以保护和利用好这些宝贵的文化遗产。