海军司令部在北京办公的地点是北京市西城区复兴门内大街69号。 这个地址是中国人民解放军总部设立的地方，海军司令部也设在这里。 这个地址位于北京市中心区域，交通十分便利，周边还有许多其他政府部门和军事机构。 因为海军司令部在此，所以能够更好地与其他军方单位进行联络和协调。