合作建房协议书是一种具有法律效力的文件，可以有效地约定合作方之间的权利和义务。 通过合作建房协议书，合作双方可以明确合作目标、合作期限、合作方式、责任分配等关键事项。 协议书的签署对于保障双方的合法权益和规范合作行为起到重要作用，一旦协议书被违反，违约方必须承担相应的法律责任。 因此，合作建房协议书是有效的，并且在合作建房过程中具有重要的法律意义。