交叉互换是非等位基因转录的原因是因为交叉互换发生在同一染色体上两个非同源的染色单体间，从而产生新的染色体组合。 这个过程中，一条染色体上的一个非等位基因与另一条染色体上的一个非等位基因进行互换，导致子代染色体组合的重新组合，从而产生新的基因型组合。 这种非等位基因的转录导致子代具有比父代更多的遗传变异，从而增加了适应环境的可能性。