如果食品中的大肠杆菌超标，处理方式应该是立即召回受影响的产品，并对整个生产过程进行全面审查和调查，以确定是何种原因导致了大肠杆菌超标。 同时，生产厂家应积极与相关卫生监管部门进行合作，共同制定有效的处理措施，确保类似问题不再发生。 此外，公司还需要对生产设备和生产线进行清洁和消毒，并进行严格的品质控制，以确保产品的食品安全标准得到遵守和实施。