根据小说《阿兰若之梦中凤九》，在故事中，凤九并不知道息泽是帝君。 虽然她与息泽有着特殊的联系和命运纠葛，但她并不清楚息泽的真实身份。 在故事中，凤九对于自己的身世并不了解，她只是一个普通的少女，对于帝君之事并没有任何认知。 直到后来，随着故事的发展，凤九才逐渐揭开了身世的谜团，与帝君的真正身份有了交集。 因此，可以得出准确的答案是凤九并不知道息泽是帝君。