附认股权证债券是公司债券与股票认股权证相结合的金融工具，持有人可以在约定的时间内转换成相应的股票；而分离交易可转债券是一种将债券的债务性质与可转换权利进行分离的债券，债券持有人可以在约定的时间内选择是否将其转换成股票。 两者的区别在于，附认股权证债券在发行时就已经将债券与股票认股权证相结合；而分离交易可转债券则是先发行债券，后将可转换权利通过交易分离出来，以便债券持有人根据市场情况自主决定是否转换成股票。