克隆人501军团的编制是由10个克隆人爵士组成的，其中每个克隆爵士指挥着一支由9个克隆人突击队员组成的突击队。 突击队员通常分为两个小队，每个小队由一个副班长指挥，副班长通常由经验丰富的克隆人突击队员担任。 每个小队中还有一个战地医疗员负责提供医疗援助。 整个编制的目的是为了在战场上实施高效的小队战术，并保证士兵之间的默契配合。